甲基化检测
浏览量: 发布时间:2023-03-14
甲基化检测
简介
DNA的甲基化(Methylation)是最早发现的基因表观修饰之一,甲基化仅修饰胞嘧啶,DNA的甲基化修饰是在DNA甲基化转移酶的作用下使CpG双核苷酸5'端的胞嘧啶转变为5'-甲基胞嘧啶,由于CpG岛主要位于基因的启动子和第一外显子区域,其甲基化修饰通常抑制基因的表达,去甲基化后基因重新活化和表达。甲基化可以影响基因的活性而不涉及DNA序列本身的改变,在维持基因组稳定性和调节基因表达中起着关键作用。
DNA甲基化在许多生物学过程中都具有重要作用,包括胚胎发育、细胞分化、基因转录调控和基因组稳定性。它也被发现与一些疾病和疾病进展有关,如癌症等。因此,研究DNA甲基化及其影响对于理解基因组功能和疾病机制至关重要。
方法
1、甲基化特异性PCR(Methylation-specific PCR,MSP):用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,未甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,甲基化的胞嘧啶不会发生改变,设计针对甲基化序列的引物进行PCR扩增,然后通过电泳等检测手段检测MSP扩增产物来确定位点是否存在甲基化。
2、亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP):与MSP相似,用亚硫酸氢盐将未甲基化胞嘧啶转化为尿嘧啶,设计BSP引物进行PCR,扩增中尿嘧啶全部转化为胸腺嘧啶,对PCR产物进行测序来判断CpG位点是否甲基化。
3、高分辨率溶解曲线法(High Resolution Melting,HRM):原理也是用亚硫酸氢盐处理,未甲基化的胞嘧啶经PCR扩增变成胸腺嘧啶,样品中的GC含量发生变化从而溶解温度发生变化,从而确定位点是否发生甲基化。
4、甲基化特异性限制酶消化: 此方法使用特异性限制酶来鉴定DNA中的甲基化位点。甲基化CpG位点可能会影响特定限制酶的酶切位点,因此可以通过消化和分析DNA片段的大小差异来检测甲基化水平。
5、甲基化芯片或测序技术: 这些高通量技术可以全面分析DNA甲基化模式,包括全基因组水平上的甲基化位点的鉴定和定量。
样品要求
1)基因信息 (请提供详细的序列或NCBI登录号)。我们会根据您提供的基因序列信息和选择的检测方法,进行甲基化检测。
2)样品要求:
基因组DNA无明显降解,总量≥10 μg,浓度≥100 ng/μl;
动物组织:不少于200 mg;
动物细胞:细胞数不少于107以上;
血液样:全血不少于0.5 ml;
植物根茎叶等组织:不少于500 mg 。